Ağız içi, milyarlarca iyi ve kötü bakterinin bir denge içinde yaşadığı karmaşık bir ekosistemdir. Geleneksel alkollü gargaralar ağızdaki iyi kötü tüm bakterileri öldürerek bu hassas dengeyi (disbiyozis) bozar ve mantar enfeksiyonlarına, daha agresif çürük ajanlarının üremesine yol açar. Holistik diş hekimliği, ağız florasını öldürerek değil, iyi bakterileri çoğaltarak korumayı hedefler. Bu amaçla Lactobacillus reuteri (prodentis vb.) suşlarını içeren özel “Oral Probiyotikler” kullanılır. Bu iyi bakteriler diş yüzeylerine ve diş etlerine tutunarak çürük yapıcı Streptococcus mutans bakterilerinin üremesini ve plak oluşturmasını engeller. Beslenmede ise rafine şekerler ve asitli gıdalar kesilerek ağız ortamının alkali kalması sağlanır; lifli sebzeler ve fermente gıdalarla iyi ağız florası sürekli beslenir.