C-şekilli kanallar, kök anatomisinin yatay kesit alındığında harfi andıracak şekilde bir şerit veya yay şeklinde sürekli bir bütün halinde olması durumudur. Bu anatomik varyasyon en sık alt ikinci büyük azı dişlerinde (özellikle Asya kökenli bireylerde) görülür. Standart kök kanalları bağımsız yuvarlak borular şeklindeyken, C-şekilli kanallarda kanallar birbirine ince dentin köprüleriyle ve yarıklarla bağlıdır. Bu durum tedaviyi aşırı derecede zorlaştırır; çünkü geleneksel döner eğeler sadece dairesel dönerek genişletme yaptıkları için bu şerit şeklindeki yarıkların ve düzlüklerin içindeki enfekte pulpa dokusuna dokunamazlar. Bu vakaların temizliğinde mekanik eğelerden ziyade, ultrasonik ve lazer aktivasyonlu yıkama sistemleri ile kimyasal doku eritici ajanların çok yoğun ve uzun süreli kullanımı şarttır, aksi halde içeride doku kalır ve tedavi başarısız olur.